Садржај

• Преглед софтвера
• Подржане врсте датотека
• Примарно проширење датотеке
• Остале екстензије датотека које користи Интегратед Геноме Бровсер 9

Версион (од 29.06.2016)	9
Платформс
Лиценца	Отвореног кода
Категорија	Сциентифиц

Више информација (посјетите веб-локацију издавача)

Оцена: 2.8 / 5 (6 Гласова)

Преглед софтвера

Главне карактеристике

• Подржава различите формате генома као што су ГенБанк и ФАСТА
• Интеракција са подацима са анимацијом зумирања и померања
• Приступите и учитајте геноме из КуицкЛоад сајтова
• Претворите податке у различите облике графикона
• Поделите податке са сарадницима преко Дропбок-а
• Инсталирајте додатке за додатну функционалност

Интегратед Геноме Бровсер (ИГБ) је програм отвореног кода који се користи за преглед и истраживање великих геномских скупова података. Можете прегледати различите формате података, комуницирати с вашим подацима, креирати графиконе, спремити информације као слике и дијелити податке са сурадницима.

ИГБ вам омогућава да прегледате податке из коментара и поравнате секвенце. Програм подржава различите формате као што су ФАСТА, БАМ, БЕДГРАПХ, БигВИГ, Цитобанд и ГенБанк. Можете узети податке и претворити их у различите облике графикона укључујући графиконе неусклађености за истицање разлика у подацима и графиконе дубине за приказ покривености. Такође можете да ступите у интеракцију са вашим подацима преко ИГБ-ових зумирања и померања анимација.

ИГБ вам омогућава да приступате и учитавате геноме из КуицкЛоад сајтова, који су једноставни системи директоријума, секвенци и других датотека са подацима за потребе визуелизације. ИГБ пружа напредну функционалност са подршком за додатке за додавање функционалности и аутоматизацију рада кроз употребу скрипти. ИГБ вам такође пружа напредне функције за дељење података, било да се ради о објављивању као висококвалитетних ЈПЕГ, ПНГ или СВГ слика, или за чување података у Дропбоку како би ваши сарадници добили приступ вашем пројекту.

ИГБ првенствено користе универзитетски истраживачи, биолози и биоинформатичари. Он обезбеђује напредне алате за отварање различитих формата података о геному, визуелизацију података као различитих графова и размену података са сарадницима. Нажалост, програм се ослања на грантове за континуирани развој, што значи да подршка за апликацију може престати у било које вријеме. Међутим, Интегратед Геноме Бровсер је и даље способан, прилагодљив програм за кориснике који желе да истраже и анализирају своје податке о геному.

Подржане врсте датотека

Примарно проширење датотеке

.КСМЛ - КСМЛ датотека

Остале екстензије датотека које користи Интегратед Геноме Бровсер 9

Подржане врсте датотека
.БЕД	УЦСЦ БЕД Аннотатион Трацк Филе
.ДАС	ДелтаМастер Аналисис Сессион
.ФА	ФАСТА форматирана секвенцијска датотека
.ФАС	ФАСТА Секуенце Филе
.ФАСТА	ФАСТА Секуенце Филе
.ГБ	ГенБанк Дата Филе
.СГР	СГР Геноме Дата Филе
.УСЕК	УСек Геноме Дата Филе